Hai vở opera của Nielsen thực sự khác nhau về phong cách. Saul og David (Saul và David) gồm bốn phân cảnh, được viết vào năm 1902 theo bản libretto của Einar Christiansen, tái hiện câu chuyện trong Kinh thánh về sự ghen tị của Saul với David trẻ trong khi Maskarade (Giả trang) là một vở kịch truyện tranh gồm ba phân cảnh được viết vào năm 1906 để một libretto của Đan Mạch của Vilhelm Andersen, dựa trên bộ phim hài của Ludvig Holberg. Saul and David đã nhận được báo chí tiêu cực khi nó được công chiếu vào tháng 11 năm 1902 và không tốt hơn khi nó được hồi sinh vào năm 1904. Ngược lại, vào tháng 11 năm 1906 Masquerade là một thành công vang dội với 25 buổi biểu diễn đặc biệt trong bốn tháng đầu tiên. Nói chung thì được coi là vở opera quốc gia của Đan Mạch, ở quê nhà, nó đã đạt được thành công và sự nổi tiếng lâu dài, nhờ có nhiều bài hát phong cách, các điệu múa và bầu không khí "Copenhagen cũ".

Nielsen đã viết một số lượng đáng kể các tác phẩm hợp xướng nhưng hầu hết chúng được sáng tác cho những dịp đặc biệt và hiếm khi được tái bản. Tuy nhiên, ba bản phổ từ thơ chính thức dành cho nghệ sĩ độc tấu, dàn nhạc và dàn hợp xướng đã tạo ra tiết mục đặc sắc. Nielsen sáng tác Hymnus amoris (Thánh ca của tình yêu), Op. 12 (1897) sau khi nghiên cứu phong cách hợp xướng đa âm thời kỳ đầu. Viết trên báo Dannebrog, Nanna Liebmann đã gọi tác phẩm là "một chiến thắng quyết định" cho Nielsen, và Angul Hammerich của Nationaltidende hoan nghênh sự trong sáng và tinh khiết được cải thiện của nó. Nhưng nhà phê bình Berlingske Tidende H.W. Schytte nghĩ Nielsen đã tỏ ra kiêu căng khi trình bày lời bài hát bằng tiếng Latinh chứ không phải tiếng Đan Mạch. [55] Søvnen (Giấc ngủ), Op. 18, tác phẩm hợp xướng lớn thứ hai của Nielsen, bắt đầu âm nhạc của các giai đoạn khác nhau của giấc ngủ, bao gồm cả nỗi kinh hoàng của một cơn ác mộng trong chuyển động trung tâm của nó, với những lời bất thường của nó, đã gây sốc cho giới phê bình khi ra mắt vào tháng 3 năm 1905. Fynsk Foraar (Springtime on Funen), Op. 42, hoàn thành vào năm 1922, đã được coi là tác phẩm Đan Mạch nhất trong tất cả các sáng tác của Nielsen vì nó tôn lên vẻ đẹp của vùng nông thôn Funen.